Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms