Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms