Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms