Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnd3P30282 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms