Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd2P30280 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms