Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms