Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col2a1P28481 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms