Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxd10P28359 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms