Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
U2af2P26369 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
U2af2P26369 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms