Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CftrP26361 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CftrP26361 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CftrP26361 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CftrP26361 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CftrP26361 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms