Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms