Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk11bP24788 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms