Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdcP23738 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdcP23738 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HdcP23738 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HdcP23738 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HdcP23738 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HdcP23738 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HdcP23738 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms