Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf8P23611 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf8P23611 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms