Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RarbP22605 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms