Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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