Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P20040 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P20040 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P20040 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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