Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnc1P19123 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms