Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30aP15533 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms