Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms