Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtcP11725 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtcP11725 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtcP11725 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms