Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP11369 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolP11369 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolP11369 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolP11369 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolP11369 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP11369 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP11369 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms