Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms