Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh1P0CB42 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms