Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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