Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms