Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefmP08553 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NefmP08553 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NefmP08553 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NefmP08553 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefmP08553 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefmP08553 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms