Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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