Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnfP06804 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnfP06804 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnfP06804 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnfP06804 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms