Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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H2-Eb1P04230 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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H2-Eb1P04230 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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H2-Eb1P04230 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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H2-Eb1P04230 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-Eb1P04230 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-Eb1P04230 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-Eb1P04230 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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