Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01734 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01734 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01734 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01734 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01734 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01734 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01734 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01734 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01734 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01734 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01734 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms