Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms