Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casp8O89110 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms