Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnkO88874 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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