Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BlmO88700 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BlmO88700 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BlmO88700 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BlmO88700 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BlmO88700 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BlmO88700 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BlmO88700 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BlmO88700 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms