Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClppO88696 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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