Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms