Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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AurkcO88445 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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AurkcO88445 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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