Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Tnnt1O88346 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Tnnt1O88346 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Tnnt1O88346 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt1O88346 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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