Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms