Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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