Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms