Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms