Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnk2O54967 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms