Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NfkbieO54910 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfkbieO54910 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms