Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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