Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms