Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CaluO35887 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CaluO35887 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CaluO35887 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CaluO35887 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms