Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Enc1O35709 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Enc1O35709 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms