Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd2O35392 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms